根据国外和国内的医学文献，低位直肠癌保肛术后可能有一些远期的并发症，但是整体发生率不高，低位直肠癌保肛后远期并发症如下：
1、保肛手术的并发症，即直肠癌的并发症，包括性功能障碍、排尿障碍。因为腹腔镜技术的进步，现在很少有神经损伤的症状，术中都注意保护患者的阴部神经、腹腔神经，保留性功能和排尿功能，所以现在这两种并发症很少出现；
2、保肛手术后可能出现排便困难，也就是肛门狭窄，原因是极个别患者没有定期扩肛，还有一部分患者吻合的时候血供不好，可以进行处理；
3、保肛手术后可能出现肛门失禁，也就是肛门功能恢复不好，这个情况非常少见，有很多因素可以造成。比如术前照射、手术中的损伤、手术中间括约肌本身的刺激等。但是绝大多数还是会恢复的，不会永久不可恢复的。