存在病毒性角膜炎时角膜炎会反复发作，尤其感染单纯疱疹病毒角膜炎，经治疗将病变控制后，病毒未被完全、彻底消灭，而是潜藏在神经节细胞内，待机体抵抗力降低时会引起角膜炎复发。单纯疱疹病毒角膜炎、带状疱疹病毒角膜炎以及带状水痘疱疹性角膜炎均存在此种特性，均可潜伏于眼睛内，待机体抵抗力下降时出现病毒性角膜炎反复发作。

若为细菌角膜炎则基本不会出现感染再复发的情况，除非再次出现新的感染，因此，角膜炎反复发作主要见于病毒感染性角膜炎。