CT检查主要是对大型的垂体瘤有临床诊断价值，1cm以下的微垂体瘤诊断效果就比较差，易遗漏。因为CT的软组织分辨率比较低，同时颅底骨质的伪影比较大，所以临床上主要推荐做磁共振检查。磁共振检查是诊断垂体瘤的主要工具，可以清楚的显示肿瘤的大小、形态、位置、与周围结构的关系，直径在约1-3mm的肿瘤,也可清晰显示。
部分肿瘤的信号与周围的正常垂体的信号组织较近似，两者难以区分。尤其小的，5mm左右的，甚至更小的，此时需要结合增强扫描，甚至垂体的动态中磁共振增强扫描，来了解区分，同时要多结合临床，根据临床表现，甚至内分泌的实验室检查进行诊断。
