肝癌检查项目主要包括实验室检查与影像学检查。中国肝癌主要见于乙肝肝硬化、丙肝肝硬化病人，因此乙肝五项、丙肝抗体检查必不可少，这是针对于肝肿瘤的特异性检查。现在最常用的甲胎蛋白、甲胎蛋白异质体以及异常凝血酶原、CA199和CEA，都是主要的肝癌检查指标。
影像学检查包括B超、B超造影、CT、核磁共振，以及数字减影、PET-CT、穿刺活检。尤其针对于小肝癌，B超造影、强化CT、强化核磁共振准确率可达到85%以上，而B超诊断率相对较低。
对于年龄＞40岁以上，尤其男性，合并有乙肝肝硬化的病人，必须半年进行体格检查，包括实验室检查、肿瘤标志物，以及B超、CT等。