再障实际上是不造血，造血机能越来越差，是一种骨髓衰竭性疾病。机体平时在骨髓造血，骨髓里有干细胞，可分化长成白细胞、红细胞、巨核细胞。巨核细胞产生血小板，红细胞继续生长红细胞，白细胞中的粒细胞生产中性粒细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞，还有淋巴细胞，例如B淋巴细胞、T淋巴细胞，B淋巴细胞主要在骨髓里生长，T淋巴细胞出生后大部分转移到胸腺。

目前有种子学说，即干细胞问题；土壤学说，即骨髓基质问题；还有虫子学说，即免疫因素造成。不论什么学说，最后均可造成三系减少，即造血干细胞不能长成分化成熟的细胞，导致白细胞、红细胞、巨核细胞缺少，以及骨髓增生不良、非造血细胞增多，例如淋巴细胞、浆细胞等非造血成分增加，即出现俗称的骨髓衰竭。