男性尿道炎通常包括淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，致病菌都是由于细菌或者支原体、衣原体、滴虫、霉菌等感染所造成。药物是以抗生素治疗为主，根据经验可以选用头孢类、喹诺酮类、大环内酯类的抗生素，也可以根据进行的药敏结果选用合适的抗生素。

对于尿道炎合并临床其他的症状，如尿频、尿急、排尿困难、排尿分叉、尿不净以及疼痛，包括盆腔的疼痛，腰部、会阴、尿道等疼痛症状，也可以采用止疼的药物，如非甾体止疼药、阿片类止疼药，或改善尿频症状的药物，如M受体阻滞剂托特罗定，或β3受体激动剂米拉贝隆，也可以采用理疗、饮水等方法针对性的进行治疗。尿道炎有时难以与前列腺炎相区别，可以根据尿道常规、尿培养、前列腺液等相应的检查进行区别和判断，然后针对性的治疗。