脑干出血要根据出血的部位和量的大小来进行治疗，但90%的脑干出血患者无法手术。还有少部分患者如果脑干出血量比较少，而且位置比较表浅，可以通过手术进行血肿清除，不至于伤害到脑干部位，引起严重后果。
脑干是生命中枢，包括人的呼吸、心跳、血压等中枢都在此，且位置很小，稍有不慎有可能会影响到生命中枢，导致死亡。所以对脑干出血的患者，大部分没有较好办法，只能通过支持、对症治疗以及血肿的自行吸收来改善症状。有一部分患者没有累及到呼吸、心跳、血压等有可能会存活，但是死亡率仍在90%以上。
所以对于脑干出血患者，治疗以对症支持治疗为主。如果出现呼吸暂停或者呼吸已经停止，可给予呼吸机改善症状，同时通过药物来维持和改善心跳和血压，主要是维持生命体征，避免发生并发症。总之，脑干出血患者是否能存活与病情有关，手术办法非常少，只有少部分患者可以进行手术治疗。
