自闭症治疗具有一定挑战性，因为面对的是大脑发育晚或大脑发育慢的状态。自闭症可发生在出生之后很短的几个月，也可发生在出生以后如2-3岁，所以治愈程度取决于个体严重程度和对个体的训练、康复和帮助的程度。若个体比较轻，临床上也能看到，这些个体经过积极训练、锻炼，能够得到与同龄儿童一样的交流水平。神经发育比较晚的个体，康复起来有一定难度，除康复以外，一定要给予营养神经细胞的药物，来帮助促进患儿快速发育。
除在学校康复，实际上康复手段还有很多，对于患儿四肢触摸，通过触摸患儿手、脚、背，这些外周感觉冲动、感觉刺激可传到大脑中间，帮助患儿感觉中枢快速发育，也有助于患儿的恢复效果。因此，预后完全取决于个体的严重程度与对患儿康复治疗的投入程度。