正常的激光脱毛仪对身体无害处，但是所有的医疗手段如果应用不当，都可能产生副作用，比如由于能量不当造成损伤过重、产生水疱甚至瘢痕。因此，激光脱毛一定要到正规机构请正规医生进行治疗。
有色人种的毛发是黑色或深色，毛干以及毛囊存在黑色素。有颜色的毛发吸光较多，当激光照射时，有黑色素的毛囊会瞬间吸收过多的光，产生热量。热量会破坏毛囊里的细胞，包括干细胞。通过治疗可以把毛囊杀死，从而达到脱毛的目的。
因此利用激光脱毛仪发射某种波长的激光，可以选择性地破坏毛囊，而对周围的汗腺、皮脂腺等没有颜色的组织不会产生损伤。
