沙眼衣原体尿道炎又称为非淋菌性尿道炎，主要表现分为两大类，第一类为排尿有刺痛感，第二类为尿道分泌物，分泌物量较少，两者可同时出现，也可表现为其中一种。非淋菌性尿道炎主要的治疗为抗生素治疗，临床上推荐药物包括左氧氟沙星、阿奇霉素、多西环素。具体用药需在医师指导下进行，同时多饮水，注意休息，避免劳累，暂停性生活。如果患者有性伴侣，要求性伴侣同时进行检查及治疗。
患者治疗后需观察尿液是否澄清、分泌物是否减少、临床症状是否消失，同时进行尿常规检测，白细胞是否消失，进行尿病原微生物培养，观察病原微生物是否消失，如果达到以上标准代表治愈。非淋菌性尿道炎病程长且迁延不愈，治疗比较棘手，需多次进行检查，明确是否有衣原体存在。
