脑囊肿治疗疗效与囊肿大小有关，部分患者可以治愈。若治疗及时，因早期囊肿压力高且小，术后囊肿逐渐缩小，受压脑组织恢复，即可治愈。若治疗不及时，囊肿变大，脑组织有明显萎缩，甚至出现癫痫，则术后脑子无法膨胀到正常大小，且会出现空腔，另仍需服药进一步治疗癫痫。