输尿管梗阻的治疗因病因的不同而异，方法包括：由输尿管狭窄等软组织本身问题造成的梗阻，可把狭窄的部分切掉，重新缝合；输尿管肿瘤，良性的可把肿瘤切掉，重新缝合，恶性的需切掉整个肾脏输尿管；结石造成的，可用腔内或体外震波碎石的方法，去掉结石。