肛门瘙痒症的预后分两个方面：原发性的肛门瘙痒症病因较不明确，治疗方面较困难，且易反复发作，继发性的肛门瘙痒症多有明确病因，去除病因后可治愈，如继发于混合痔、肛瘘的肛门瘙痒症，通过治疗混合痔、肛瘘可缓解并治疗瘙痒，继发于全身性的疾病，如糖尿病或内分泌功能紊乱引起的肛门瘙痒，治疗难度较大。