骨髓增生异常综合征的检查方法如下：

1、血常规：了解红细胞、粒细胞、血小板数量有无减少；

2、骨髓穿刺、活检：了解骨髓增生程度，如粒系统、红系统、巨核细胞血小板系统增生情况，以及细胞形态是否异常；

3、染色体检查：了解有无细胞遗传学异常。包括核型检测、FISH，也称探针杂交。判断染色体核型、数量、结构有无异常；

4、基因检测：综合分析、判断是否符合骨髓增生异常综合征，也称MDS的诊断标准。