肛周脓肿应首选手术治疗。因肛周脓肿是由肛门腺感染引起的化脓性疾病，而肛门腺呈开口向上、口大底小的形状，人体排便时，粪便会顺着肛门腺方向流入人体，形成肛周感染化脓。这类感染较深，用药物一般难以控制，且未及时手术后感染易扩散，延长恢复时间、增加患者痛苦，故肛周脓肿不推荐单纯药物治疗。