直肠脱垂病因尚未明确，经研究可与以下因素有关：
1、解剖因素：儿童患者直肠垂直度较成人垂直，当腹内压增高时，直肠缺乏有力支撑而导致直肠脱垂。部分女性多因分娩次数过多或分娩过程中，会阴撕裂导致支撑结构破坏，引起直肠脱垂；
2、腹内压增高：主要见于长期便秘、咳嗽，老年男性前列腺增生，此类患者因长期腹内压增高压迫直肠向下移位，亦形成直肠脱垂；
3、神经因素：伴有神经系统疾病的患者，直肠脱垂发病率较高；
4、手术、外伤：引起肛门局部结构损伤，导致肛门周围肌肉支持功能减弱，形成直肠脱垂。