75%的脑血栓病人均遗留不同程度的后遗症，根据病情表现而决定。如部分病人可能存在失语，特别是表达性失语或理解性失语病人，后遗症可能较为严重，难以恢复，因为言语是人类高级中枢，所以恢复较为困难，但只要有毅力，坚持锻炼，有部分改善的可能性。此外，较严重的后遗症是肢体瘫痪，特别是大面积脑梗死病人或脑干梗死病人，可能均遗留偏瘫后遗症、运动障碍，无法下地行走，可能需要家人照料。
部分病人可能存在吞咽困难，可能需通过鼻饲、长期胃管给予胃肠道营养，以维持营养所需。部分病人可能遗留肢体麻木，特别是丘脑梗死病人，可能运动并无问题，但主要感觉为存在不适，偏侧肢体或一侧肢体存在表达不出的不适，而此类感觉障碍也留有不同程度的后遗症，恢复存在一定困难。部分病人可能表现是关节疼痛，因肢体瘫痪后关节挛缩，肢体表现疼痛，如关节疼痛，肘关节活动后较为疼痛。
