功能性消化不良的治疗方法如下：

1、一般治疗：建立良好的饮食和生活习惯，保持情绪平稳，心态健康；

2、药物治疗：西医治疗可使用抑制胃酸分泌药物，或促胃动力药物，中医应对患者辨证后选择对症药物；

3、针灸治疗：疏肝解郁、活血止痛，迅速缓解胃肠不适症状；

4、保健治疗：通过揉腹，或刺激足三里等保健穴位，有效缓解消化不良症状；

5、心理治疗：部分患者可接受心理治疗。