脑炎的发生与病原菌侵袭能力以及感染人群免疫状态有关，尽量避免感染、接触病原体。平时多加锻炼、增强抵抗力，避免淋雨、受凉等情况出现。大部分脑炎可以治愈，但重症脑炎可能会危及患者生命。

即使经过治疗，也可能出现后遗症。重症患者表现为早期昏迷、高热不退，癫痫持续状态甚至出现脑疝、脑死亡。经过及时抢救可出现植物状态、认知障碍甚至持续存在癫痫发作。