病原微生物侵犯到脑实质称为脑炎，侵犯到脑膜称为脑膜炎，根据病情轻重程度，住院时间在14-21天左右。病情好转者可以继续在门诊接受口服药物治疗。脑炎患者经过治疗出院后，常遗留精神症状，需要继续接受药物治疗，及时到医院复诊。单疱脑炎至少要抗病毒治疗一个月以上。如合并癫痫发作，至少服用药物2-3年，根据癫痫控制情况，逐渐减量，直到停用。