狼疮性肾炎患者病情严重程度取决于其病理分型，不同分型预后不同。患者肾脏损害严重程度与系统性红斑狼疮预后关系密切，多数狼疮性肾炎患者肾损害程度较轻，一般以不同程度蛋白尿及镜下血尿多见；约1/6患者初期确诊时可出现肾功能下降，患者主要表现为肌酐清除率下降。部分病人虽然存在临床症状，但并未发展为肾功能不全。

系统性红斑狼疮患者主要死因是由于肾功能衰竭及狼疮性脑病合并感染；肾脏受累及进行性肾功能损害为系统性红斑狼疮最重要死亡原因之一。高血压和肾功能衰竭常具有一致性，为影响狼疮肾炎患者预后的重要因素。对于系统性红斑狼疮必须重视肾脏并发症，即系统性红斑狼疮性肾炎。