介入治疗包括血管内介入治疗和血管外介入治疗。肛瘘可以介入治疗，肛瘘镜治疗是肛瘘介入治疗的主要手段。

与传统的肛瘘切开引流方法不同，肛瘘镜治疗不切开括约肌，从肛道外口进入，沿肛窦的窦道，将窦道内坏死组织及管壁清除，直到内口，结合术后肛瘘栓填塞，达到治疗肛瘘的目的，但复发率相对较高，约50%以上，因此未能广泛开展。