慢性阻塞性肺疾病最常见的并发症为慢性肺源性心脏病。慢性阻塞性肺疾病的慢性缺氧状态可导致肺动脉高压，并逐渐形成肺心病，甚至右心衰竭。其次，慢性阻塞性肺疾病也容易并发栓塞性疾病，如深静脉栓塞、肺栓塞。此外，由于肺的结构毁损而形成的肺大疱很容易破裂，常导致自发性的气胸，所以自发性气胸也是常见的并发症之一。