先天性巨结肠手术在过去属较大型手术，且并发症较多，对患儿损伤较大，由于肠管部位需全部暴露于体表外，因此对患儿损伤大，恢复慢。随着现代医学技术的提高，在腹腔镜下或经肛门即可完成手术，手术无需开腹，腹腔内无需过多游离，手术步骤经过简化更安全，手术难度虽无改变，但由于操作步骤减少，手术时间得到相应缩短，因此目前巨结肠手术在小儿外科手术中属中型手术。