慢性肠炎是较少提的一种叫法，发病原因较多，炎症性肠病、细菌性痢疾、肠结核或吸收不良综合征等都可能引起腹痛、腹泻，可能均属于所谓的慢性肠炎。根据不同原因，其治疗方法不同，治疗方法包括抗炎治疗、抗感染、免疫调节、益生菌、肠道免疫功能调节，及中医、中药治疗，中药辨证论治，有口服汤剂、中成药局部灌肠、贴敷疗法；针灸、艾灸、针刺等。