依据脊索瘤的部位和体积可决定其手术方法：

1、颅底高位脊索瘤：手术非常困难，仅能进行边缘切除、刮除；

2、骶椎高位脊索瘤：即第三骶椎以上，依据具体情况可以整体切除或者边缘性切除，手术效果较差，复发率较高；

3、骶椎低位脊索瘤：即第三骶椎以下，需要进行彻底切除；

4、脊索瘤远处孤立转移或者原发于脊柱或者转移到脊柱：均需对症手术处理。