胃镜可以观察到病灶的表面，而超声内镜则可以观察病灶内部的情况，比如浸润的深度。肿瘤侵犯黏膜下层以上的叫早期胃癌，肿瘤侵犯黏膜下层至固有肌层的，属于进展期胃癌。只有超声内镜可以了解肿瘤侵犯的层次。对于胃腔内隆起的病灶，超声内镜另外一个作用就是可以了解肿瘤起源的层次及扩散方向。因此可以为医生提供更多立体的信息。