引起小儿二尖瓣畸形的原因如下：

1、先天因素：由于瓣膜发育不良，瓣下结构发育不良，造成二尖瓣狭窄和关闭不全。或由于其他原因导致的二尖瓣和三尖瓣的反流；

2、瓣膜风湿性改变：导致二尖瓣关闭不全或二尖瓣狭窄，及亚急性细菌性心内膜炎，造成二尖瓣有赘生物的形成，影响瓣膜的关闭和开放，形成二尖瓣功能的损害，这些患者均需早期治疗。