内分泌性骨质疏松，通常指由其他内分泌性疾病造成的继发性骨质疏松。甲状腺功能亢进及2型糖尿病，可引起骨钙快速流失，造成骨质疏松；甲状旁腺激素可调节影响钙、磷的代谢，甲状旁腺功能亢进一般会引起严重的骨质疏松，部分少见的内分泌性肿瘤，可分泌调磷因子，使体内的磷大量排出，血磷较低时可引起骨骼内磷释放，造成骨质疏松。糖尿病引起的骨质疏松进展相对较慢，但甲状腺功能亢进、甲状旁腺功能亢进或内分泌性肿瘤引起的骨质疏松其进展非常快，患者可能较短时间内即出现骨痛、骨折。