病毒性食管炎根据感染病毒不同，治疗时间和使用药物不同，具体如下：

1、单纯疱疹病毒性食管炎和水痘疱疹病毒性食管炎建议使用阿昔洛韦，静滴或口服，配合抑酸、促进胃动力药物，防止胃酸反流，损伤食管黏膜，疗程7天左右；

2、巨细胞病毒性食管炎一般是由于免疫力低下感染所致，采用抗病毒治疗，建议使用更昔洛韦2周左右。