肺结核的确诊方式包括：

1、金标准：在患者痰液、纤支镜灌洗液等相关体液中找到结核菌，但并非所有病人均可确诊；

2、病理组织检查：针对菌阴肺结核患者，通过肺穿刺活检、胸腔镜活检获取病灶相关组织进行确诊。

上述途径均不能达到确诊的情况下通过PPT试验、T-SPOT等辅助检查进行综合判断，最终通过诊断性抗结核治疗效果以确诊。