胆总管结石的治疗，主要是通过外科手术将胆总管结石取出，或者通过内镜下经由胆总管下段将结石取出，主要根据患者胆管结石的大小、数量、胆总管内镜的宽度、患者的年龄、是否合并有胆囊结石以及其他并发症，采取相应的治疗方法。胆总管结石可由于胆囊结石掉入到胆总管形成继发性胆管结石，或者原发于肝内、肝外胆管，由于胆管的炎症、异物感染等也可以引起原发性胆管结石。
胆管结石在胆管内可以堵塞胆管，引起胆汁排出不畅，胆道内压力升高，胆汁反流入血，形成黄疸、腹痛，甚至合并寒战、发热等，这种情况有可能危及患者的生命，所以胆总管结石一旦确诊，则建议尽快通过外科手术或内镜将胆管结石取出。如果同时合并有胆囊结石，也建议通过外科手术将胆囊切除，避免再次形成胆管结石的可能。
