肝内胆管结石的治疗原则是取净结石、解除梗阻、清除病损、充分引流。具体治疗方法如下：

1、保肝微创治疗：内镜下行胆管逆行造影以取出结石；内镜下行球囊扩张，将胆管狭窄部位扩张后，于内镜下取石；

2、手术切开取石：包括高位胆管切开取石、胆肠吻合内引流、肝段或肝叶切除等。肝段、肝叶切除，通常适用于肝内胆管结石聚集的较密集的情况。