角膜移植术后应常规应用激素或环孢素、FK506等免疫抑制剂一年以上，若患者为高危人群，可口服抗排斥药物。一旦出现排斥症状，无论为内皮排斥、基质排斥或上皮排斥，均应加大局部激素或环孢素、他克莫司等免疫抑制剂用量，并根据排斥程度选择滴眼、结膜下或静脉给药方式。一般情况下，由于角膜无血管存在，移植术后的排斥率较低，但若未炎症、感染、化学损伤或免疫性疾病导致角膜损伤，则术后的排斥率较高；若为圆锥角膜，或单纯外伤导致角膜损伤，无明显炎症表现，排斥率相对较低。