手术治疗是食管癌治疗的主要手段。一般在切除肿瘤后，需将胃部上提，进而与食管相接，因此肿瘤生长的部位越高、切除的食管越多，胃上提得越高。

若为颈段食管癌，其手术治疗几乎需将整个食管切除，将胃上提，由于胃会分泌胃酸，如果平躺可能导致胃酸流到下咽，导致患者出现不适感。因此，颈段食管癌患者不适合进行手术治疗，主要是胸段以及下段食管癌患者进行手术治疗。

目前，还可通过胸腔镜进行食管癌的手术治疗，创伤较小，清扫范围较大，效果较好。