若先天性心脏病患者出现低烧的症状，如体温略高于38℃，则问题较小；若患者体温达到39-40℃，且出现其他的症状，如寒颤、发抖，则需引起重视。患者出现发热症状，则提示细菌已进入患者血液，继而进入心脏畸形部位，可能引起感染，导致感染性心内膜炎，危害程度较大，通常需使用2-3种较强的抗生素进行治疗，若抗生素治疗无效，则需到心脏外科就诊，将引起感染的部位切除，更换为新的没有细菌的结构。