大部分病窦综合征是由原发病导致，窦房结功能下降后心率变慢，患者脏器供血不足，可引发相应症状。心脏、脑、肾供血主要靠心脏搏动，心率过慢会造成搏动减少，重要脏器输血也会减少。若脑部缺血较明显，会出现头晕、乏力、心慌等症状。若心率减慢程度加重，会进一步出现记忆力减退，类似植物神经功能紊乱。再严重即出现黑蒙甚至阿斯发作，阿斯发作是由于心率急剧减慢而造成脑部严重供血减少，严重者危及生命。