新生儿脓疱疹治疗方法包括：

1、局部治疗：在脓疱疹部位外用抗生素软膏，部分软膏新生儿不能使用，所以应在医生指导下应用。如果脓疱疹较大时，可由医护人员将脓疱疹挑破后，再外涂抗菌药物；

2、全身治疗：由于金黄色葡萄球菌毒力较强，较容易并发败血症、脑膜炎、化脓性关节炎等疾病，所以需要进行全身性抗生素用药，建议由医生详细评估后，再行足疗程、规范化诊疗。