脑干胶质瘤往往最常见的有两种类型，一种是弥漫性的内生型的脑桥胶质瘤，还有一种是局灶性的脑干胶质瘤。它们都会有不同的症状。脑干的功能非常复杂，有不同的核团，这时候不同的位置可以导致不同的症状。

其中包括颅神经的麻痹、瘫痪或共济失调，可以占到一半以上的患者。最常见的累及的颅神经是面神经和听神经，其中有1/10的患者可以在就诊时出现脑积水，导致颅内压增高。

还有一些患者在诊断时会出现肿瘤的出血，但大部分出血是比较少的。而儿童患者有出血的概率会高一些，可以达到20%，往往发生在肿瘤坏死的区域。但是在延髓、颈髓交界处的肿瘤通常表现为后组颅神经的功能障碍，临床病程往往比较长，甚至可以达到很多年。