肾盂输尿管连接部梗阻的治疗方法是解除梗阻，解除梗阻的方法有很多，如不能耐受手术的可以置管，也可以造瘘，但如果情况允许采取手术把梗阻解除是最好的方法。手术的选择有一定的根据，不是肾盂输尿管出现狭窄一律去做手术，部分患者梗阻以后影响肾功能，造成肾盏、肾盂扩张，对肾实质产生压迫需手术干预；部分患者不是特别严重，肾盂、肾盏扩张程度不足以立刻采取措施，但症状很明显，如疼痛影响生活质量，这也是选择方法的一个根据。治疗上手术解除梗阻是首选，其它的方法需根据患者的病情，如全身状况、狭窄程度、有没有合并症等进行选择。