头孢克肟可以用于治疗阑尾炎。阑尾炎首选手术治疗，但部分病人因为各种原因，选择观察和保守治疗。保守治疗的方法最主要是抗生素治疗，如果病情不重，通过保守治疗可以痊愈。阑尾与胃肠道相连，所以阑尾炎最常见的致病菌是大肠埃希菌。

大肠埃希菌是革兰氏阴性杆菌，三代头孢对其较敏感。头孢克肟是口服三代头孢，所以用头孢克肟治疗阑尾炎，大多数情况有效。但肠道细菌除了革兰氏阴性杆菌，还有厌氧菌，多数情况下为混合感染。通常建议病人在抗生素治疗效果不好的情况下，联合使用抗厌氧菌药物如甲硝唑、奥硝唑，可以达到较满意的治疗效果。