巨结肠手术大部分可以治愈，但是巨结肠手术以后最常见的并发症主要有以下几条：

1、污粪：巨结肠孩子到年龄很大，甚至到小学生，内裤都是不干净，老有污粪，肛门括约肌控制不好，所以导致污粪；

2、顽固便秘：做完手术还是顽固便秘，尽管临床上病变范围已经完全切除，还是会出现便秘；

3、肠炎：经常便秘的孩子容易发生肠炎，往往是小肠结肠炎。

这是巨结肠术后比较常见的三种并发症，当然还有其他更严重的，比如大便失禁，控制不住，因为肛门口做了手术，括约肌发育不完善或者手术当中损伤比较大，所以术后控制方面就会差很多。