淋病并发症相较于普通的一些淋菌性尿道炎、宫颈炎，它的症状较重，病程一般也较长，所以淋病并发症治疗的疗程是相对较长。使用的药物与普通的、常规的淋病是同样的。也可使用头孢曲松钠1g/d，疗程一般至少10天。如对头孢曲松钠过敏，可选用大观霉素2g/d，疗程也是10天。女性患者合并盆腔炎感染，通常需加用多西环素和甲硝唑，进行抗厌氧菌感染治疗。如出现少见的并发症，如心内膜炎、心包炎、脑膜炎，疗程应相应延长，一般疗程在14-28天左右。