幽门螺杆菌的检查方法主要分为两大类，包括胃镜下检查和非胃镜检查。胃镜下检查一般通过做胃镜取胃部的一小块组织，一般取胃窦部位，即幽门螺杆菌容易聚集的部位。首先可以用培养法，把所取组织放在培养皿里，给予适合的生长条件，看是否有细菌生长；胃镜下检查也可以用快速尿素酶法，测定所取组织的尿素酶含量判断；还有也可以通过显微镜下，直接观察胃组织是否存在幽门螺杆菌感染，这三种办法主要是通过胃镜的检查方法进行。非胃镜方法，临床上用的最常见的也是最方便的方法是吹气试验，即C-13或C-14呼气试验。根据同位素标记判断，即服用对比剂以后，通过吹气来判断前后变化，判断是否存在幽门螺杆菌感；还有通过抗体检测，主要是检测血液或尿液中是否有幽门螺杆菌抗体；抗原检测，主要通过检测大便中是否存在幽门杆菌抗原。
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