小儿抽动症目前病因还不明确，有多种学说。首先与遗传因素有关，以神经生理、生化代谢和环境因素以及发育过程中所受到的影响等因素有关。主要如下：

1、遗传因素：有研究表明，如果父母有抽动症，孩子发病率也比较高，双胞胎发病率也相对比较高；

2、一些研究发现抽动症的病人脑内部分生化物质合成障碍；

3、脑的结构或功能异常，部分研究发现抽动症患儿，脑部基底节部位发育异常；

4、心理因素：儿童在学校、家庭和社会等受到各种因素刺激，会出现精神紧张、焦虑，这些因素也会导致抽动症的发生。