脊髓栓系需根据其严重程度决定预后，单纯的脊髓栓系为终丝牵拉所致，如果在症状很轻的情况下做手术，预后非常好，甚至大便功能，双下肢的运动、感觉基本上不受影响。
但有一些除了终丝牵拉以外，还合并有骶管脂肪瘤，以及骶神经发育不良，这些比较复杂的脊髓栓系的患儿，会产生一些后遗症和并发症，逐渐影响其大便的功能和双下肢的运动感觉，还会引起下肢关节的改变，甚至出现畸形。