儿童肺炎衣原体弱阳性有两种可能性：

1、儿童处于感染衣原体的初始阶段，此时抗体还没有大量形成，呈现弱阳性；

2、儿童以前感染过肺炎衣原体，现在正处在恢复阶段，抗体越来越小，也可呈现弱阳性。

肺炎衣原体是一种较特殊的病原微生物，体积比细菌小，因此在很多医院无法用常规培养基进行培养后再进行病原微生物鉴定，因此一般会采取血液中抗原抗体检测来判断有无衣原体感染。