三叉神经痛手术最主要的并发症包括听力减退、面部感觉减退，甚至有些会出现嘴角歪斜等面瘫症状，还会影响咀嚼运动。所以在三叉神经微血管减压的手术过程当中，会要求进行咀嚼肌的电生理监测，怕术后影响患者的咀嚼运动。但随着神经外科显微技术的提高，并发症的发生率逐步减小，现在发生率基本上很低，听力减退虽然较难恢复，但听力减退的发生率基本上在1%之内。除了听力减退这个并发症较难恢复以外，大多数如上所说面肌痉挛、面部抽动、面部感觉减退、咀嚼肌运动减退等症状都比较轻微，而且术后基本在一个月左右的时间就可以逐步恢复，大部分不会留下长久的并发症，都为暂时性质。三叉神经和面听神经挨得比较近，所以手术过程中会骚扰到面听神经，所以其产生的并发症主要是听力减退和面部感觉减退以及面瘫等情况。
