膀胱结石的治疗大部分考虑膀胱结石形成的原因，在早期中国的发病情况，膀胱结石是原发的，多数跟营养状况有关，但随着目前经济的改善，膀胱结石多数是继发于前列腺而发生的疾病。

针对膀胱结石的治疗首先的治疗原则是以去除结石为第一目的，同时第二要针对病因的治疗。针对膀胱结石的处理过程中选择的手术方式目前是以微创技术为主的手段，手术包括从尿道进去膀胱碎石取石，同时经过尿道把引起膀胱结石的前列腺增生处理掉。处理膀胱结石在病情许可、病人身体耐受的情况下，需要同时做两个手术来解决。