根据肝脓肿的类型，分为细菌性肝脓肿和阿米巴性肝脓肿，其病因有所不同，具体如下：

1、细菌性肝脓肿：全身各部位化脓性感染，尤其是腹腔内感染，可以通过下述途径进入肝脏，即胆道、门静脉、肝动脉、创伤、异物、邻近器官蔓延所致。脓液培养提示，革兰氏阴性菌多于革兰氏阳性菌，常见为大肠杆菌、链球菌和葡萄球菌，机体抵抗力减弱也是本病发病的重要内因；

2、阿米巴性肝脓肿：多是由于阿米巴病虫侵入肝脏后引起，是一种传染性疾病，一般经粪-口途径传播，多见于温热带，农村较城市多见。